@article { author = {Karami, Maryam and Rafat, Seyedabbas and Moghaddam, Gholamali and Shodja Ghiass, Jalil and Javanmard, Arash}, title = {The association between single nucleotide polymorphisms of BRCA1 gene with mastitis in Holstein cattle}, journal = {Animal Sciences Journal}, volume = {31}, number = {119}, pages = {191-208}, year = {2018}, publisher = {Animal Science Research Institute of Iran}, issn = {2588-6436}, eissn = {2588-6428}, doi = {10.22092/asj.2017.109862.1417}, abstract = {Enhancing disease resistance in animal production can be achieved by genetic improvement programs. Candidate gene polymorphism is one of the potential approaches for search of association between SNP within this gene phenotype of animals, particularly in MAS for mastitis of large dairy cattle populations. Polymorphism of exon 9 of the BRCA1 gene was investigated by the PCR-RFLP method in 60 Iranian Holstein cattle. In this study, 3 different alleles were recognized. Polymerase chain reaction-restricted fragment length polymorphism method was used to amplify, digestion and electrophoresis for a 219 base pair of bovine BRCA1 gene. A polymorphism was revealed by G-A single nucleotide polymorphism in +46126 position of BRCA1 gene. Observe genotype frequencies for KK, KL, LL were 0.27, 0.43 and 0.30 respectively, and allele frequencies for observed K and L allele were 0.48 and 0.52 accordingly. For analysis of variance, normality test and transformation of raw data for SSC records was performed based on previous main reports and literature reviews. GLM and logistic regression methods was used for association study between genotype and collected phenotype. As a final message of the present report, KK genotype was showed significantly affect SCC data and has tendency for low SCC score than other two genotypes. The results of present study indicated BRCA1 gene as an effective candidate gene could be benefit for mastitis resistant in Marker Assisted Selection strategies in dairy cattle.}, keywords = {Allele,BRCA1 gene,Holstein cattle,mastitis,SNP}, title_fa = {ارتباط چندشکلی های تک نوکلئوتیدی ژن BRCA1 با بیماری ورم پستان در گاوهای هلشتاین}, abstract_fa = {با استفاده از برنامه های اصلاح ژنتیکی می توان مقاومت نسبت به بیماری ها را در حیوانات افزایش داد. درانتخاب ژنتیکی علیه بیماری ورم پستان در گاوهای شیری از چندشکلی ژن کاندیدا استفاده می شود. چندشکلی ژن کاندیدا برای یافتن ارتباط میان SNP با فنوتیپ حیوان و به ویژه استفاده از آن در برنامه انتخاب به کمک نشانگر است. بدین منظور وجود چندشکلی اگزون 9ژن BRCA1 در 60 نمونه از گاوهای هلشتاین ایرانی با استفاده از روش PCR-RFLP بررسی شد که سه آلل مختلف در این بررسی شناسایی شدند. چندشکلی در جایگاه 46126+ از ژن BRCA1 با جهش G-A آشکار شد. فراوانی های ژنوتیپی به ترتیب برای سه نوع ترکیب ژنی بانامگذاری KK، KL وLL معادل 27/0، 43/0 و30/0 و دو آللی K وL برابر 48/0 و52/0 بدست آمد. برای مطالعه ارتباط ژنوتیپ و رکوردهای حاصل از شمارش سلول های بدنی از رویه GLMو رگرسیون لجستیک استفاده شد. افراد دارای ژنوتیپ KK به طور معنی داری نسبت به دو ژنوتیپ دیگر میزان سلول های بدنی کمتری داشتند. نتایج نشان داد که جایگاه مورد نظر در ژن BRCA1 به عنوان یک ژن مؤثر در مقاومت به ورم پستان می تواند در استراتژی های انتخاب به کمک نشانگر مورد استفاده قرار گیرد. چنین به نظر می رسد استفاده از تعداد نمونه بیشتر و بررسی ژن های کاندیدای دیگر می تواند برای دست یافتن به آزمونی با دقت بالاتر برای شناسایی حیوانات حساس و مقاوم به ورم پستان مؤثر باشد.}, keywords_fa = {آلل,چندشکلی تک نوکلئوتیدی,گاو هلشتاین,ورم پستان,ژنBRCA1}, url = {https://asj.areeo.ac.ir/article_117309.html}, eprint = {https://asj.areeo.ac.ir/article_117309_a8155625bd599c4c9ee8fbc57fe483c7.pdf} }