%0 Journal Article %T استخراج رابطه علّی- معلولی ترانسکریپتومی در بافت غدد پستانی گاو شیری با استفاده از شبکه بیزی %J علوم دامی %I موسسه تحقیقات علوم دامی کشور %Z 2588-6436 %A مرتضوی, امین %A رشیدی, امیر %A قادری زفره‌ای, مصطفی %A مرادی, پرهام %A رزم کبیر, محمد %D 2019 %\ 08/23/2019 %V 32 %N 123 %P 197-216 %! استخراج رابطه علّی- معلولی ترانسکریپتومی در بافت غدد پستانی گاو شیری با استفاده از شبکه بیزی %K ریزآرایهDNA %K ورم پستان %K ژن‌های تنظیمی %K هستی‌شناسی %R 10.22092/asj.2018.121024.1656 %X هدف از این مطالعه، شناسایی ژن‌های تنظیمی مؤثر در بروز بیماری ورم پستان در گاو شیری با استفاده از داده-های ریزآرایهDNA بود. بدین منظور فایل بیان ژنی با بیشترین تعداد آرایه و متعلق به پلت‌فرم افی‌متریکس GPL1221 با شماره دسترسی GSE24560از پایگاه GEO استخراج شد. برای آزمون کنترل کیفیت داده از بسته‌یArrayQualityMetrics و برای پیش‌پردازش داده‌ها از تابع Threestep بسته‌ی AffyPLM در محیط R استفاده شد. پس از شناسایی ژن‌های متفاوت بیان‌شده، الگوریتم جستجوی تابو در بسته bnlearn برای شناسایی ژن‌های تنظیمی مورداستفاده قرار گرفت. نتایج حاصل از این پژوهش بیانگر نقش علّی و تنظیمی ژن‌های BCL2A، CCL2، S100A12، AOX1 و MGP بر بیان سایر ژن‌ها در بافت پستانی گاو شیری بود. بررسی هستی‌شناسی ژن‌ها، تفاوت معنی‌داری را در 7 گروه عملکردی مولکولی، 48 گروه فرآیندهای زیستی و 11 گروه اجزای سلولی در شرایط بروز بیماری ورم پستان در بافت غدد پستانی نشان داد. همچنین نتایج غنی-سازی مجموعه داده‌های بیان ژنی نشان داد بیشتر ژن‌های متفاوت بیان‌شده در این پژوهش به طور معنی داری(p < 0.05) در مسیرهای متابولیکی (GO:0009605، GO:0002376 و GO:0006954) فعال بوده و در فرآیندهای پاسخ به بروز عوامل بیماری‌زا، پاسخ‌ ایمنی و پاسخ به التهاب در بافت پستانی گاو شیری نقش دارند. %U https://asj.areeo.ac.ir/article_120025_acf90d76d3d7c6c74810b5173f8cd49b.pdf