بررسی ساختار ژنتیکی بخشی از ناحیه پروموتر در ژن لاکتوفورین درشترهای تک کوهانه و دو کوهانه ایران

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد.

2 استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد.

3 استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد.

چکیده

شیر شتر یکی از منابع پروتئینی غنی به شمار می آید. لاکتوفورین یکی از پروتئین های مهم آب پنیر شیر شتر می باشد. نواحی پروموتری، نواحی هستندکه در بیان ژن اهمیت ویژه ای دارند. هدف از این تحقیق بررسی ساختار ژنتیکی بخشی از ناحیه پروموتر ژن لاکتوفورین به طول 790 نوکلئوتید، بین دو گونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران بود.10 نمونه خون از شتر تک کوهانه و 5 نمونه خون از شتر دو کوهانه جمع آوری شد. ناحیه مورد نظر با استفاده از آغازگر های اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. با استفاده از آنالیزهای ژنتیکی ، ساختار ژنی لاکتوفورین مورد بررسی قرارگرفت. پس از همترازی توالی های ژنی به دست امده، 4 هاپلوتایپ در نژاد های تک کوهانه و3 هاپلوتایپ در نژاد های 2 کوهانه مشاهده گردید. همچنین 12و 10 موتیف به ترتیب در شتر های تک کوهانه و دو کوهانه مشاهده شد. در نتیجه با توجه به اینکه اطلاعاتی از ساختار و توالی پروتئین های شیر شتر خصوصاٌ در نژاد های ایرانی موجود نبود، به طور کلی به نظر می رسد انجام مطالعات تکمیلی جهت تعیین ساختار ژن این پروتئین و همچنین آنالیز ساختار این پروتئین بتواند اطلاعات تکمیلی مفیدی از تغییرات و تنوع احتمالی این ژن در گونه های ایرانی داشته باشد.

کلیدواژه‌ها


Agrawal, R.P., Swami, S.C., Beniwal, R., Kochar, D.K., Sahani, M.S., Tuteja, F.C. and Ghouri, S.K. (2003). Effect of camel milk on glycemic control, risk factors and diabetes quality of life in type-1 diabetes: a randomised prospective controlled study. Journal of Camel Practice and Research. 10(1), 45-50.
Beg, O.U., Von Bahr-Lindström, H., Zaidi, Z.H. and Jörnvall, H. (1987). Characterization of a heterogeneous camel milk whey non-casein protein. FEBS Letters. 216(2), 270-274.
Baumhueter, S., Mendel, D.B., Conley, P.B., Kuo, C.J., Turk, C., Graves, M.K., Edwards, C. A., Courtois, G. and Crabtree, G.R. (1989). HNF-1  shares  three  sequence  motifs  with the  POU  domain  proteins  and  is  identical to  LF-B1  and  APF. Genes and Development. 4(3), 372-379.
Courtois, G., Morgan, J.G., Campbell, L.A., Fourel, G. and Crabtree, G.R. (1987). Interaction  of  a  liver-specific  nuclear  factor with  the  fibrinogen  and alpha 1-antitrypsin  promoters. Science. 238(4827), 688-692.
Courtois, G., Baumhueter, S. and Crabtree, G.R. (1988). Purified hepatocyte nuclear factor 1 interacts with a family of hepa- tocyte-specific promoters. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 85(21), 7937-7941.
ELagamy, E.I., Nawar, M., Shamsia, S.M., Awad, S. and Haenlein, G.F.W. (2009). Are Camel Milk Proteins Convenient to the Nutrition of Cow Milk Allergic Children? .Small Ruminant Research. 82:1-6.
Fucharoen, S., Shimizu, K. and Fukumaki, Y. (1990). A novel C–T transition within the distal CCAAT motif of the gamma-globin gene in the Japanese HPFH: Implication of factor binding in elevated fetal globin expression. Nucleic Acids Research. 18, 52-45.
Grontved, L., Mandrup, S. (2009). Mus muscle is peroxisome proliferator activated receptor Gamma. Transcription Factor Encyclopedia.
Gu, M., Liu, Q., Watanabe, S.H., Sun, L., Hollopeter, G., Grant, B.D. and Jorgensen, E.M. (2013). AP2 hemicomplexes contribute independently to synaptic vesicle endocytosis. E life. 2(00190).  
Johnsen, L.B., Petersen, T.E. and Berglund, L. (1996). The bovine PP3 gene is homologous to the murine GlyCAM-1 gene. Gene. 169: 297-298.
Kappeler, S., Heuberger, C., Farah, Z. and Puhan, Z. (2004). Expression of the peptidoglycan recognition protein, PGRP, in the lactating mammary gland. Journla of Dairy Science. 87(8), 2660-2668.
 Kappeler, S., Farah, Z. and Puhan, Z. (1991). Alternative Splicing of Lactophorin mRNA from Lactating Mammary Gland of the Camel (Camelus dromedarius). Journal of Dairy Science. 82:2084–2093.
 Kenzhebulat, S., Ermuhan, B. and Tleuov, A. (2000). Composition of camel milk and its use in the treatment of infectious diseases in human. In: Proceedings of the 2nd Camelid Conference on Agroeconomics of Camelid Farming, Almaty, Kazakhstan, September 8–12, AgroMerkur Publication,, 101.
 Lum, L.S., Dovc, P. and Medrano, J.F. (1997). Polymorphisms of bovine beta-lactoglobulin promoter and differences in the binding affinity of activator protein-2 transcription factor. Journal of Dairy Science. 80(7), 1389-1397.
 Lai, E., Prezioso, V.R., Tao, W., Chen, W. S. and Darnell, J.E. (1991). Hepatocyte nuclear factor 3 alpha belongs to a gene family in mammals that is homologous to the Drosophila homeotic gene fork head. Genes and Development. 5: 416–427.
Magjeed, N.A. (2005). Corrective effect of milk camel on some cancer biomarkers in blood of rats intoxicated with aflatoxin B1. Journal of Saudi Chemical society. 9(2), 253–263.
 Malewski, T. (1998). Computer analysis of distribution of putative cis- and Trans regulatory elements in milk protein gene promoters. Biosystems. 45(1), 29-44.
 Szymanowska, M., Malewski, T. and Zwierzchowski, L. (2003). Transcription factor binding to variable nucleotide sequences in 5′-flanking regions of bovine casein genes. International Dairy Journal. 14(2), 103-115.
 Pjanic, M., Schmid, C.D., Gaussin, A., Ambrosini, G., Adamcik, J., Pjanic, P., Plasari, G., Kerschgens, J., Dietler, D., Bucher, P.H., Mermod, N. and Mermod, N. (2013). Nuclear Factor I genomic binding associates with chromatin boundaries. BMC Genomics. 14(99), 1471-2164.
 Shabo, Y., Barzel, R., Margoulis, M. and Yagil, R. (2005). The Israel Medical Association Journal. Immunology and Allergy. 7(12), 796-798.
 Stefan, K. (1998). Compositional and structural analysis of camel milk proteins with emphasis on protective proteins. Diss. ETH No. 12947.
Watson, C., Gordon, K., Robertson, M. and Clark, J. (1991). Interaction of DNA-binding proteins with a milk protein Gene promoter in vitro: identification of a mammary gland-specific factor. Nucleic Acids Research. 19(23), 6603-6610.
 Wedel, A. and Ziegler-Heitbrock, H.W. (1995). The C/EBP Family of Transcription Factors. Immunobiology. 193(2-4), 171-185.
 Food and Agriculture Organization (2000). Biodiversity: Agricultural biodiversity in FAO. Retrieved January 12, 2009, from http://www.fao.org/biodiversity.