شناسایی جایگاه‌های کنترل کننده صفات کمّی (QTL) برای صفات رشد در بزهای تجاری استرالیا

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز

2 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.

3 استادیار، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

4 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

5 موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

چکیده

امروزه، کاربرد توأم اطلاعات فنوتیپی و نشانگرهای مولکولی برای بهبود صفات رشد توانسته است کارآیی برنامه‌های اصلاح نژادی را به بازدهی نسبتاً مناسبی برساند. هدف از پژوهش حاضر شناسایی جایگاه‌های کنترل کننده صفات کمّی (QTL) مرتبط با صفات وزن و خصوصیات رشد با استفاده از نشانگرهای اختصاصی ریزماهواره‌ درگستره 605 سانتی‌مورگانی از کروموزوم‌های بز می‌باشد. بدین منظور، از یک گله بزرگ با بررسی اطلاعات شجره، تعداد چهار خانواده برادر- خواهر ناتنی که مجموع کل خانواده 112 رأس بودند، انتخاب شد. صفات تحت رکورد برداری شامل: وزن‌های تولد، ازشیرگیری، شش ماهگی، میانگین افزایش وزن روزانه، نسبت‌های کلیبر محاسبه شده برای دو دوره تولد تاسن از شیردهی و دوره شیردهی تا سن شش ماهگی بودند. سپس در فاز مطالعه مولکولی، در مجموع تعداد 45 نشانگر ریزماهواره پراکنده بر روی تعداد 5 کروموزوم (1، 2، 5، 6 و 26) با پیش شرط روئیت الگوی هتروزیگوت برای آن نشانگر در بزهای نر هر خانواده در نتاج، تعیین ژنوتیپ شدند. از نتایج کلیدی مطالعه حاضر، شناسایی دو QTL بین نشانگرهایBMC1009-RM029 و INRABEN172 که در کروموزوم 5 و 26 با وزن تولد مرتبط هستند، می‌باشد (0/01>p). همچنین بعد از تجزیه و تحلیل فامیلی یکQTL نزدیک نشانگر BM1312 در ارتباط با نسبت کلیبر(KBR1) در کروموزوم یک تشخیص داده‌ شد(0/05>p).

کلیدواژه‌ها


ساقی، د.ع.، اسلمی نژاد، ع.‌ا.، طهمورث‌پور، م.، نصیری، م.ر و داشاب، غ.ر. (1391).  مکان یابی جایگاه‌های صفت کمّی (QTL) موثر بر وزن بدن در بخشی از ژنوم گوسفند بلوچی.  نشریه علوم دامی (پژوهش و سازندگی). دوره 25، صفحه 57 – 49.
Beckman, J. S., and M. Soller. )1983(. Restriction fragment length polymorphisms in genetic improvement-methodologies, mapping and costs. Theoretical  Applied Genetics. 67:35–43
Casas, E., Shackelford, S.D., Keele, J. W., Koohmaraie, M., Smith, T. P. L. and Stone, R.T. (2003). Detection of quantitative trait loci for growth and carcass composition in cattle. Journal of Animal Science. 81:2976-83. 
Churchill, G. A. and Doerge, R.W. (1994). Empirical threshold values for quantitative trait mapping. Genetics, 138:963–971.
Dekkers, J.C. M. (2004). Commercial application of marker- and gene assisted selection in livestock: strategies and lessons. Journal Animal  Science. 82 (E Suppl.), E313–328.
Dodds, K.G., McEwan, J.C. & Davis, G.H.(2007). Integration of molecular and quantitative information in sheep and goat industry breeding program. Small Ruminant Research. 70, 32-41.
Ellegren, H. (2004). Microsatellites: Simple sequences with complex evolution. National Review Genetics 5(6): 435-45.
Esmailizadeh, K. A., Mohammad Abadi, M R., Asadi Foozi, M.( 2008). Mapping quantitative trait loci in livestock using simple linear regression. Iranian Journal Animal Science. 39, 83–93.
Ezmailizadeh, A.K.(2010). A partial genome scan to identify quantitative trait loci affecting birth weight in Kermani sheep. Small Ruminant Research. 94, 73–78.
FAO. (2007) Status of animal genetic resources. In: The state of the world’s animal genetic resources for food and agriculture (Ed. by D. Pilling & B. Rischkowsky), pp. 23–49. FAO, Rome.
Goldstein, D. B. and Pollock, D. D. (1997). Launching microsatellites: A review of mutation processes and methods of phylogenetic inference. Journal of Heredity 88: 335-342.
Green, P., Falls, K. and Crooks, S. (1990). Documentation for CRI-MAP, version 2.4. Washington University School of Medicine, St. Louis.
Kleiber, M. (1947). Body size and metabolic rate. Physiology Review. 27:511–541.
Knott, S.A., Elsen, J.M. and Haley, C. S. (1996) Methods for multiple marker mapping of quantitative trait loci in half-sib populations. Theoretical and Applied Genetics 93, 71–80.
Lander, E. and Kruglyak, L. (1995). Genetic dissection of complex traits: guidelines for interpreting and reporting linkage results. Nature Genetics, 11: 241–247.
Lander, E. S. and Botstein, D. (1989). Mapping Mendelian factors underlying quantitative traits using RFLP linkage maps. Genetics, 121: 185-199.
Maddox, J. and Cockett, N.(2007). An update on sheep and goat linkage maps and other genomic resources. Small Ruminant Research. 70, 4–20.
Menezes,W.H.Sous,E.P.Cavalcanti-Filho,L.T.Gama.(2016).Genetic parameters for reproduction and growth traits in Boer goatsin Brazil.Small Ruminant Research136 (2016) 247–256
Mohammedabadi, M. R., Askari N., Baghizadeh A. and Esmailizadeh, A. K. (2009) A directed search around caprine candidate loci provided evidence for microsatellites linkage to growth and cashmere yield in Rayini goats. Small Ruminant Research81,146–51.
Raadsma, H., Thomson, P., Zenger, K., Cavanagh, C., Lam,M., Jonas, E., Jones,M., Attard, G., Palmer, D. and Nicholas, F.(2009). Mapping quantitative trait loci (QTL) in sheep. I. A new male framework linkage map and QTL for growth rate and body weight. Genetic Selection and Evaluation. 41, 34.
Renaville, R., Gengler, N., Vrech, E., Prandi, A., Massart, S., Corradini, C., Bertozzi, C., F. Mortiaux, Burny, A. and Portetelle, D. (1997). Pit-1 gene polymorphism, milk yield, and conformation traits for Italian Holstein-Friesian bulls. Journal of Dairy Science. 80, 3431–3438.
SAS. (2009). SAS, SAS/sat user's guide, release 9.1. SAS Institute Inc., Cary, NC, USA
Vaiman 1996
Vaiman, D., Schibler, L., Bourgeois, F., Oustry, A., Amigues, Y.  and Cribiu E. P. (1996) A genetic linkage map of the male goat genome. Genetics 144, 279–305.
Van derWerf, J. H.J., Marshall, K., . and Sanghong, L.(2007). Methods and experimental designs for detection of QTL in sheep and goats. Small Ruminant Research. 70, 21–31.
Visser, C., Van Marle-Kster, E., Snyman, M.A., Bovenhuis, H. and Crooijmans, R..P.M.A. (2013) Quantitative trait loci associated with pre-weaning growth in South African Angora goats. Small Ruminant Research112, 15–20.
Walling, G. A., Visscher, P. M.,  Wilson, A. D.,  McTeir, B. L., Simm, G. and Bishop, S. C. (2004). Mapping of quantitative trait loci for growth and carcass traits in commercial sheep populations. Journal of Animal Science. 82:2234–2245.
Weller, J. I.(2009). Quantitative Trait Loci Analysis in Animals. CABI Publishing, London, UK;
Yeh, F. C., Boyle, T. and Yang, R. (1999). Popgene version 1.31. Microsoft window based freeware for population genetic analysis. University of Alberta Canada.